傳統森田療法的實施主要采取門診治療和住院治療兩種形式。鑒于大學咨詢的特殊情況，我們將重點介紹森田正馬的得意弟子高良武久關于森田療法過程和步驟的論述，而只對傳統的門診治療、住院治療作簡單介紹。
住院治療是一種綜合性治療，通過改變患者的環境，幫助患者擺脫惰性，領悟到煩悶即解脫的道理。住院患者集體生活，通過交流治療體驗，不僅可以改善人際關系，而且有助于能量的外向化。大家同病相憐，從而拋棄以前固有的癥狀“唯我獨有”的個人觀，而形成一種“世人如此”的宇宙觀。
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森田療法住院治療的具體操作和實施 住院治療一般分為四個階段：絕對臥床期、輕工作期、重工作期和生活訓練期。分別闡述如下：（1）絕對臥床期 讓患者在一安靜的房間內臥床，禁止會客、讀書、談話、抽煙、聽廣播等，除吃飯、洗漱和大小便外，保證絕對臥床。要求患者聽任強迫觀念出現，可以盡可能地去想自己的一切，但患者必須忍受一切痛苦，不能采取任何措施。當患者痛苦到極點時，在極短暫的時間內會迅速消失，即為森田的所謂“煩悶即解脫”的含義。此種體驗可以讓患者領悟到人的情感有其自己活動的規律，意志無法加以操控。繼續的臥床會使患者感到無聊，想起床做任何事情。遂可進入第二期。一般3－7天；（2） 輕工作期讓患者從事室內和室外的輕體力勞動，仍不允許患者過多地與別人交談，禁止看書報、抽煙等活動。夜間臥床7－8小時，每天戶外散步2－3小時，晚上記日記。要求患者盡量抑制強迫行為，帶著強迫觀念堅持工作，讓患者逐步恢復體力，通過工作的完成使其認識到堅持行動與癥狀減弱的關系，從而接受癥狀使之自然淡化。由于患者解除了對癥狀的關注，對勞動越來越感興趣，渴望得到較多較重的工作，遂可轉入第三期。此期一般3－7天；（3） 重工作期 主要在園藝治療區從事重體力勞動，包括挖地、除草、栽樹、清理環境衛生等，并繼續做上一期的工作。每天早晨、傍晚進行強體力鍛煉。晚間可看一些一般性讀物，后期可閱讀有關森田療法理論的讀物。讓患者學會對癥狀置之不理，以積極有益的活動代替強迫行為。要求患者每晚記日記。通過努力工作，使患者體驗完成工作后的喜悅，培養忍耐力，進一步將精神活動能量轉向外部世界。此期為3－7天；（4 ）生活訓練期可外出、回家、回單位、參加集會和文娛活動，指導患者回歸原來的社會環境，恢復原來的社會角色，為患者出院作準備。無論參加何種活動，都要求每晚仍回病房，每天堅持寫日記。使患者在真實的社會情境中進一步體驗順應自然的原理，為回歸社會做好準備。此期為1至2周。以上是對一般治療情況的描述，針對每個患者，還要根據實際情況作好治療計劃。治療過程中要防止過多的說教，關鍵在于幫助患者在順應自然的態度下積極行動。
門診治療最初只是為個別沒有條件做住院治療的患者所設立，后來，因門診治療是把那些癥狀比較輕而且尚能適應社會生活的人作為治療對象，所以近年來，門診療法不論是在日本還是中國，所起的作用都在擴大。
門診治療主要是按照森田療法的治療原則，通過個體咨詢的形式進行的，一般一周1－2次，每次50分鐘左右。通過一般的咨詢技術與患者建立良好的咨訪關系，在此基礎上，全面了解患者的情況，讓患者了解客觀事物是不以人的意志為轉移的，我們的情感活動有其自身的活動規律，我們無法用意志對其加以控制。但是我們的意志可以調控行動，通過積極行動可以陶冶神經質性格，轉移對癥狀的關注，從而達到減輕乃至消除癥狀的目的。治療的關鍵是幫助患者理解順應自然的道理，接受自己的情感波動，接受癥狀本身及其帶來的痛苦，打破精神交互作用，“忍受痛苦，為所當為”。
森田正馬的得意弟子高良武久對森田療法作了創造性的發揮與補充。他所總結的森田療法的治療過程與理念對大學心理咨詢是很有啟發意義的。具體觀點概括如下：
l 讓治療者解釋你的處境的心理機能上的本性。確保你能理解為什么如此感受著你的感受。
l 徹底讓你的癥狀如其所是的存在。你必須接受，你的癥狀已經完全和你本人合為一體了。
l 把你自己絕對地，毫無保留地投入工作。
l 絕對地不要抱怨任何東西。永遠不要提起你的癥狀，也不要把注意力轉向它們。
l 期望征服那種“逃進病癥中”的誘惑并為征服作好準備。在一開始你的癥狀也許會有些加重，但你得把這種發展看成是無意義的而予以忽視。
l 為了找出那些反常行為的源頭，開始檢查你自身。你是在何時第一次學會以這種無益的自私的方式來思考的？你這些無禮舉動的原型是什么？
l 試著嘗試做沒有把握的事情。
l “去帶著苦惱生活吧”必須成為你的座右銘。你必須把不安當作你的居所。
l 調整你的外部形象，以便你不以一個神經質的病人的形象出現在世界上。帶著個好的表情；嚴肅認真果斷地投入你目前的工作。
l 承認并依賴你的體內平衡。你的恢復將是自然的，如果你恢復了你自然地思考和行為的能力。
